一、印花稅
印花稅是平時容易忽視的小稅種，但注銷的時候一定要會被翻個底朝天。實收資本、資本公積、營業(yè)賬簿、租賃、購銷合同以及企業(yè)成立以來的重大合同都是檢查的重點。
印花稅采用的是正向列舉的方法，凡是《印花稅暫行條例》中規(guī)定的合同，都應(yīng)該繳納印花稅，相反沒有列舉的，則不用繳納。建議企業(yè)先自查一遍，該補稅的及時補稅。
二、個人所得稅
財稅[2003]158號規(guī)定，老板自公司借款，一個納稅年度沒有歸還，也沒有用于生產(chǎn)經(jīng)營的，應(yīng)該視同分配股息紅利，按照20%扣繳個稅。
因此，企業(yè)注銷前一定要好好自查一下“其他應(yīng)收款”科目。
三、賬面存貨低價銷售
很多企業(yè)注銷時賬面都有存貨，可以低價銷售出去嗎？答案是可以。
通常企業(yè)處理臨期商品或因清償債務(wù)、轉(zhuǎn)產(chǎn)、歇業(yè)等原因進行降價銷售商品的，一般可視為有正當(dāng)理由的低價銷售行為，不會被稅務(wù)局視為價格偏低而進行核定。
四、賬面庫存分配給投資者
一家商貿(mào)公司，賬面有一批20萬元的商品，市場價格是25萬元，注銷時，計劃將商品分配給股東。
按照《增值稅暫行條例實施細(xì)則》的規(guī)定，將商品分配給投資者應(yīng)該視同銷售，應(yīng)繳納的銷項稅是3.25（25*13%）萬元。
五、庫存損毀了怎么處理?
一家商貿(mào)公司,在注銷時發(fā)現(xiàn)，一批113萬元的存貨由于管理不善毀損沒有價值了，這批貨物前期已經(jīng)抵扣了進項稅。
由于是管理不善導(dǎo)致的毀損，注銷時應(yīng)該轉(zhuǎn)出進項稅13（113/1.13*13%）萬元。
六、留抵稅額能退嗎？
根據(jù)財稅〔2005〕165號的規(guī)定，企業(yè)注銷后，期初存貨中尚未抵扣的已征稅款，以及留抵稅額，稅務(wù)機關(guān)都是不再退還的。
企業(yè)可以將相當(dāng)于該部分進項稅額的貨物銷售給關(guān)聯(lián)公司，產(chǎn)生銷項稅，同時能給關(guān)聯(lián)公司開具進項發(fā)票，將留抵的稅額轉(zhuǎn)嫁給關(guān)聯(lián)公司。和關(guān)聯(lián)公司的交易是要有商業(yè)理由，真實存在的。虛開發(fā)票不可��！
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